El Programa Nacional de Alianzas no desarrolló una teoría a partir de la cual promover o montar alianzas y asesorarlas. Por el contrario, partió de las experiencias específicas de alianzas para sistematizar un aprendizaje sobre el qué, el porqué, el cómo y los resultados de las alianzas. Las estrategias desarrolladas fueron:

• la identificación, documentación y difusión de casos de alianzas entre gobiernos, organizaciones sociales y empresas privadas;
• el análisis y la sistematización de los beneficios de las alianzas y los medios para lograrlas;
• la divulgación de las lecciones y el fortalecimiento de la capacidad local para establecer alianzas y,
• el reconocimiento público de los innovadores y el apoyo a las alianzas establecidas.

El Programa Nacional de Alianzas funcionó como una alianza constituida a nivel central por la Fundación Corona y el Banco Mundial, con el apoyo del Departamento para el Desarrollo Internacional del Reino Unido y la Fundación Interamericana, y a nivel regional por universidades y centros de investigación que actúan de forma descentralizada a través de seis nodos regionales.

Cada nodo regional asumió, con el apoyo de la Coordinación General del programa, el soporte de la universidad y bajo la responsabilidad del coordinador general, la convocatoria a los ciclos anuales de identificación, documentación y divulgación de alianzas y en general todas las actividades del programa. Los nodos operaron de la siguiente manera:  Antioquia, Chocó y Córdoba; Caldas, Risaralda y Quindío; Atlántico, Cesar, Magdalena, San Andrés, Sucre, Bolívar y Guajira; Valle del Cauca; y Cundinamarca, Boyacá, Meta, Amazonas, Vichada, Guainía, Guaviare, Vaupés, Bogotá.

Economía, desarrollo social y económico.

Después de identificar 468 alianzas, de documentar 51 casos y tras seis años de implementación, el programa confirmó seis de sus  hipótesis iniciales:

• las alianzas constituyen una estrategia innovadora y efectiva para gestionar la solución de problemas sociales.
• las alianzas generan sinergias y aprendizajes entre los socios;
• producen soluciones innovadoras,
• entregan resultados concretos,
• mejoran la racionalidad y productividad en el uso de recursos y la sostenibilidad de las iniciativas, e
• incrementan el capital social.