Uno de los componentes más interesantes de APROFA es el Programa de Representaciones Sociales y Derechos, una apuesta institucional por mejorar las condiciones en que las personas ejercen y promueven sus derechos sexuales y reproductivos en Chile. Busca generar y potenciar las capacidades institucionales, colectivas e individuales de la población para desarrollar acciones ciudadanas de reivindicación y promoción de derechos. Asimismo, el programa pretende contribuir para modificar las creencias, prejuicios y mitos que limitan la posibilidad de que las personas vivan su sexualidad de manera plena, informada y responsable. Este componente se desarrolla desde diversas estrategias:

• Difusión y Promoción: En este ámbito elabora materiales de difusión, participa en acciones ciudadanas dirigidas a informar y estimular la participación de la población, elabora e implementa estrategias innovadoras de difusión, y genera espacios de diálogo con diversos actores sociales en torno a la situación de los derechos sexuales y reproductivos en Chile.
• Advocacy: se refiere a las prácticas encaminadas a influenciar el proceso de formulación e implementación de políticas públicas y la articulación de colectivos a partir de intereses ciudadanos, para promover causas frente al Estado y/o a la sociedad. Su propuesta es que si bien es importante conseguir modificaciones legislativas, estas deben ir aparejadas al empoderamiento ciudadano, el cambio cultural y la participación social. En coherencia con esto desarrolla acciones de promoción de políticas progresistas en materia de salud y derechos sexuales y reproductivos.
• Asociatividad: Como reconoce que el alcance de las problemáticas que aborda como institución va mucho más allá de sus capacidades  organizacionales, APROFA trabaja permanente y sistemáticamente por la conformación y consolidación de alianzas estratégicas con otras organizaciones e instituciones de la sociedad civil. 

Salud reproductiva, VIH/SIDA, juventud.

El trabajo de APROFA está especialmente dirigido a jóvenes de ambos sexos residentes en comunas populares de la Región Metropolitana de Santiago, miembros de organizaciones estudiantiles, mujeres jóvenes organizadas, minorías sexuales, gestores culturales, instituciones de educación superior, sindicatos, y personas dispuestas a participar en acciones de difusión y reflexión en torno a la sexualidad y los derechos sexuales y reproductivos. Su apuesta última como organización es promover la implementación de políticas públicas y cambios legislativos que permitan a la sociedad en su conjunto alcanzar estándares superiores de ejercicio de sus Derechos Sexuales y Reproductivos.